依据代谢物质的有无或多少来显示病原菌侵染植物的过程。荧光蛋白标记病原菌结合激光共---扫描显微镜观察可以揭示在亲和与非亲和状况下病原菌侵染过程的组织学和细胞学特征，可以比较病原菌侵染不同抗性种质的差异或不同小种侵染同一种质的差异。但是尚不清楚孢子如何地粘附到植物表面，是被物理的或化学的信号---，冬瓜蔓枯病用什么药，还是孢子与植物表面存在着非常专化的相互作用，有待进一步的研究。
病菌为菌丝体、菌核、厚垣孢子在土壤、病残体或未经高温腐熟的肥料中越冬，也可以在种子上越冬，成为第二年的初侵染源。病株茎基部表面所见粉红色霉层是病菌的菌丝体、分生孢子和厚壁孢子。该菌有较强的腐生性，在无寄主条件下，能在土壤中存活6年以上。厚垣孢子及菌核通过牲畜---道后仍不失掉活力。所以，连作地和施用未充分腐熟有机肥的地发病重。土壤中休眠的甜瓜枯萎病菌，第2年受到瓜类蔬菜根系分泌物的---，可---休眠，在适宜的温、湿度下萌发出牙管，从根部、根尖或伤口侵入，
棉花枯萎病的病原为尖孢镰刀菌萎蔫专化型（学名：fusarium oxysporum f. sp. vesinfectum (atk.) snyder et hansen）。菌丝透明，具分隔，在侧生的孢子梗上生出分生孢子。大型分生孢子镰刀形，略弯，两端稍尖，具2-5个隔膜，多为3个，大小（22.8-38.4）微米×（2.6-4.1）微米在，尖孢镰刀菌萎蔫专化型大型分生孢子分为三种培养型：ⅰ型纺缍形或匀称镰刀形，多具3-4个隔，足胞明显或不明显，为典型尖孢类型；
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